Enterobacterales resistentes a carbapenemes: estudio epidemiológico de aislamientos en un hospital público de Santa Fe / Carbapenem-resistant Enterobacterales: Epidemiological study of isolates in a public hospital in Santa Fe

Introducción: La incidencia de Enterobacterales resistentes a carbapenemes (ERC) se elevó en la última década, y en especial durante la pandemia de COVID-19. Objetivo: Conocer el perfil de resistencia antimicrobiana, así como la frecuencia y tipo de carbapenemasas presen-tes en los aislamientos de ERC en un hospital regional.Materiales y métodos: Estudio epidemiológico, observa-cional y retrospectivo. Incluyó ERC aislados en muestras clínicas durante 2021 en un hospital regional de Santa Fe, Argentina. El cálculo de la incidencia (aislamientos/pacien-tes-día) e intervalo de confianza 95% (IC 95%), y las pruebas estadísticas se realizaron con OpenEpi.Resultados: 348 ERC aislados (11,9 aislamientos/1000 pacientes-día; IC95% 10,7-13,2). La incidencia se correla-cionó con los casos de COVID-19 (rho=0,874, p<0,001) y fue a expensas de la Unidad de Cuidados Intensivos (76,4%). El principal ERC aislado fue Klebsiella pneumoniae (71,4%, n=260). KPC fue el principal mecanismo de resistencia (61,2%). Se aislaron dos doble productores de carbapene-masas. La tasa global de resistencia a los antibióticos no betalactámicos evaluados fue superior en Klebsiella pneu-moniae que en el resto de los aislamientos resistentes a carbapenemes (60,6% vs. 38,5%, p<0,001). En KPC hubo mayor resistencia a colistin (44,6% vs. 23,9%, p=0,001) y menor a amikacina (23,9% vs. 72,6%, p<0,001).Conclusión: Frente a las escasas opciones terapéuticas en infecciones por ERC se destaca la importancia de conocer los mecanismos de resistencia implicados y la epidemiología local

Introduction: The incidence of carbapenem-resistant Enterobacterales (CRE) rose in the last decade, and especially during the COVID-19 pandemic.Objective: To identify the antimicrobial resistance profile, as well as the frequency and type of carbapenems that were present in CRE isolations in a tertiary care hospital.Materials and methods: Epidemiological, observational and retrospective study. It included CRE isolated in clinical samples during 2021 in a tertiary care hospital in Argentina. Incidences (isolations/patients-day), confidence intervals of 95% (CI 95%) and statistical comparisons were made with OpenEpi.Results: 348 CRE were isolated (11.9 isolations/1,000 patients-day, IC95% 10.7-13.2). Incidence correlated to COVID-19 cases (rho=0.874, p<0.001). Most isolations were from the Intensive Care Unit (76.4%) and the from respiratory samples (27.6%, n=96) and blood cultures (24.4%, n=92). The main isolated CRE was Klebsiella pneumoniae (71.4%, n=260), with a general carbapenem resistance of 53.4%. KPC was the main resistance mechanism (61.2%). Two double carbapenemase-producing Enterobacterales were isolated. Klebsiella pneumoniae presented a higher overall resistance rate to non-betalactam antibiotics (60.6% vs 38.5%, p<0.001). Among CRE, a higher colistin resistance rate was found in KPC isolations (44.6% vs 23.9%, p=0.001) and lower resistance to amikacin (23.9% vs 72.6%, p<0.001).Conclusion: The difficulty in the selection of antibiotic regimens for CRE forces the treating physicians to put emphasis on the knowledge of resistance mechanisms to optimize them

Rising incidence of carbapenem resistant isolates: an Argentinian hospital's experience. More trouble in the aftermath of the COVID-19 pandemic / Incidencia creciente de aislamientos resistentes a carbapenémicos: la experiencia de un hospital argentino. Más problemas tras la pandemia de COVID-1

Introduction: During COVID-19 outbreaks, disproportionate use of antibiotics, high Intensive Care Units burden and longer in-hospital stays may have aggravated the emergency posed by carbapenem-resistant isolates. Therefore, we set out to determine whether the incidence of carbapenem-resistant isolates rose in a tertiary care center in Santa Fe, Argentina during the period with active cases of COVID-19. Material and methods: In this retrospectively designed analytic epidemiologic study, two periods were defined: Period 1 (without active cases of COVID-19) from September 2019 to August 2020 and Period 2 (starting at the onset of the first wave of COVID-19 in this Institution) from September 2020 to June 2021. All clinically relevant microbiological samples taken during these periods in the Internal Medicine, Surgical and Intensive Care Unit wards were included. The primary analysis of interest was the differential incidence between the two periods, overall and in the Intensive Care Units wards in particular. Results: 9,135 hospitalizations, 50,145 patient-days of analysis. 7,285 clinical samples were taken, with an overall positivity for carbapenem-resistant isolates of 12.1% (n=883). Overall carbapenem-resistant isolates incidence during Period 2 was 2.5 times higher than in Period 1 (2.52 vs 0.955/100 patient-days, p<0.001). Intensive Care Units' carbapenem-resistant isolates incidence raised from 6.78 to 8.69/100 patient-days in Period 2 (p=0.006). Conclusions: We found alarming rates of carbapenem-resistant isolates in our center, 2.5 times higher in the period following the first wave of COVID-19. This rise was due to a higher amount of clinically relevant microbiological samples taken and to a higher carbapenem resistance among Enterobacteria and non-fermentative Gram-negative bacilli. To our knowledge, this is one of the few Latin-American reports on the effect of the COVID-19 pandemic on carbapenem-resistant isolates incidence (AU)

Introducción: Durante los brotes de COVID-19, el uso desproporcionado de antibióticos, la alta carga de las Unidades de Cuidados Intensivos y las estancias hospitalarias más prolongadas pueden haber agravado la emergencia planteada por los aislados resistentes a carbapenémicos. Por lo tanto, nos propusimos determinar si la incidencia de aislamientos resistentes a carbapenémicos aumentó en un centro de tercer nivel de atención en Santa Fe, Argentina, durante el período con casos activos de COVID-19. Material y métodos: En este estudio epidemiológico analítico de diseño retrospectivo se definieron dos periodos: Periodo 1 (sin casos activos de COVID-19) de septiembre de 2019 a agosto de 2020, y Periodo 2 (a partir del inicio de la primera ola de COVID-19. en esta Institución) desde septiembre de 2020 hasta junio de 2021. Se incluyeron todas las muestras microbiológicas clínicamente relevantes tomadas durante estos períodos en las salas de Medicina Interna, Quirúrgica y Unidad de Cuidados Intensivos. El principal análisis de interés fue la incidencia diferencial entre los dos períodos, en general y en las salas de las Unidades de Cuidados Intensivos en particular. Resultados: 9.135 hospitalizaciones, 50.145 pacientes-día de análisis. Se tomaron 7.285 muestras clínicas, con una positividad global para aislados resistentes a carbapenémicos del 12,1% (n=883). La incidencia general de aislamientos resistentes a carbapenémicos durante el Período 2 fue 2,5 veces mayor que en el Período 1 (2,52 frente a 0,955/100 pacientes-día, p<0,001). La incidencia de aislamientos resistentes a carbapenémicos en Unidades de Cuidados Intensivos aumentó de 6,78 a 8,69/100 pacientes-día en el Período 2 (p=0,006). Conclusiones: Encontramos tasas alarmantes de aislamientos resistentes a carbapenémicos en nuestro centro, 2,5 veces mayores en el período posterior a la primera ola de COVID-19 (AU)